夏四月，達率諸將出塞，友德為前鋒。軍至北黃河，敵駭遁。友德選輕騎夜襲灰山，克之，擒其平章孛羅不花、太史文通等。沐英領兵出古北口，獨當一面，搗高州、嵩州、全寧諸部，過驢駒河，獲知院李宣並其部眾而還。
　　十五年（壬戌，一三八二）五月，上聞士卒海運多溺死者，命群臣議遼東屯田。
　　十八年（乙丑，一三八五）二月，國子監祭酒宋訥獻守邊策，大略謂：「備邊在足兵，足兵在屯田。宜選諸將軍智謀勇略者數人，每將以東西五百里為制。隨其高下，立法分屯，布列緣邊之地，遠近相望，首尾相應，遇敵則戰，寇去則耕，此長久之法也！」上嘉納之。
　　二十年（丁卯，一三八七）春正月壬子朔，命宋國公馮勝為大將軍，潁國公傅友德為左副將軍，永昌侯藍玉為右副將軍，南雄侯趙庸、定遠侯王弼為左參將，東川侯胡海、武定侯郭英為右參將，率師北征納哈出。上諭勝等曰：「納哈出詭詐，未易得其虛實。爾等且駐師通州，遣人覘其出沒。彼若在慶州，宜以輕騎掩其不備。既克慶州，則以全師逕搗金山，出納哈出不意，必可擒矣。」既而復遣前所獲乃刺吾北還，以書諭納哈出等。
　　二月甲申，馮勝等兵至通州，遣邏騎出松亭關，聞敵騎有屯慶州者，遣右副將軍藍玉將輕兵出關襲之，殺其平章果來，擒其子不蘭奚，獲人馬而還。
　　三月辛未，馮勝等率師出松亭關築大寧、寬河、會州、富峪四城遂駐兵大寧。
　　夏六月庚午，馮勝留兵五萬守大寧，率大軍趨金山。辛未，上敕諭勝等：「納哈出去金山未遠，以兵促之，勢必來降且元主謂我得志，無意窮追，必順逐水草，往來黑山、魚海之間，掩其無備，彼眾可盡獲也。」丁酉，勝等至遼河東獲納哈出屯卒三百人，馬四百餘匹，遂進師駐金山之西。時乃刺吾還至松花河，納哈出見之大驚，相勞問，乃刺吾因諭以朝廷送還之意。納哈出喜，即遣其左丞劉探馬赤、參政張德裕至軍門獻馬，且因以覘我。勝遣人送赴京師。乃刺吾復備以撫恤之恩語其眾，由是部落多有降意。時臨江侯陳鏞所部與大將軍異道相失，陷敵，死之。丁未，勝等率師踰金山至女直若屯，納哈出部將全國公觀童來降。初，納哈出分兵為三營：一曰榆林深處，一曰養鵝莊，一曰龍安一禿河。輜重富厚，畜牧蕃息，元主數招之不往。至是，大將軍逼之，納哈出計窮，乃刺吾因勸之降。納哈出猶豫未決，勝遣馬指揮往諭之。納哈出乃遣使至大將軍營，陽為納款，而更覘兵勢。勝即遣藍玉往一禿河受之，使還報，納哈出指天嘖嘖曰：「天不復與我有此眾矣！」遂率數百騎詣藍玉降。玉大喜，出酒與之飲，甚相歡。納哈出酌酒酬玉，玉解衣以衣之，謂曰：「請服此而後飲。」納哈出不肯服，玉亦持酒不飲。爭讓久之，納哈出取酒澆地，顧其下咄咄語，將脫去。時鄭國公常茂在座，其麾下趙指揮者，解胡語，以告茂，茂直前搏之，納哈出大驚，起就馬，茂拔刀砍之，傷臂不得去，耿忠遂以眾擁之見勝。納哈出所部妻子將士凡十餘萬，在松花河北，聞納哈出被傷，遂驚潰。餘眾欲來追，勝遣前降將觀童往諭之，於是其眾悉降，凡四萬餘，羊馬駝驢輜重亙百餘里。納哈出有二姪不肯降，勝遣人諭之，乃折弓矢於地，亦來降。勝以禮諭納哈出，加慰諭，令耿忠與同寢食，遣使奏捷，奏常茂驚潰降眾，遂班師。悉以納哈出來降將卒妻子及其輜重俱南行。仍以都督濮英將騎兵三千為殿。初，納哈出之降也，餘眾驚潰者皆竄匿，及聞大軍還，以其降眾俱行，甚恨之，乃設伏於途，候大軍過而邀之。英等後至，伏發，猝為所乘，眾寡不敵，英馬蹷被執。英絕食不言，乘間剖腹而死。
　　秋七月丁酉，納哈出所部營王失刺八禿等來降。
　　八月壬子，上聞馮勝等在軍中多不律，遣使戒諭之。
　　癸酉，馮勝械常茂至京。茂，勝之壻也。勝每於眾中卑折之，茂不能堪，出不遜語，勝銜之。及納哈出降而眾驚潰，勝乃歸咎於茂，奏之。茂至，陳所以降納哈出之故。上曰：「如爾言，勝亦不得無罪。」命收其總兵印，召勝還，令永昌侯藍玉總兵代之。
　　九月戊寅，納哈出至京，封為海西侯。詔左副將軍傅友德編集新附軍士，駐兵大寧防寇。
　　丁未，以永昌侯藍玉為大將軍，延平侯唐勝宗、武定侯郭英為左、右副將軍，都督僉事耿忠、孫恪為左、右參將，率兵討殘元，肅清沙漠。
　　冬十一月甲午，藍玉奏：「元丞相哈刺章、乃兒不花遁入和林，乞進兵剿滅。」許之。
　　二十一年（戊辰，一三八八）夏四月，藍玉率師自大寧進至慶州，聞元主脫古思帖木兒在捕魚兒海，間道兼程而進。乙卯，師至百眼井，去捕魚兒海四十餘里，哨不見敵，玉欲引兵還。王弼曰：「吾等提十萬眾，深入沙漠，未見敵而班師，何以復命！」玉然之。弼復請戒諸軍，皆穴地而爨，毋令敵望見煙火，師遂進丙辰，至捕魚兒海南飲馬，偵知元主營在海東北八十餘里。玉以弼為前鋒，直薄其營。敵始謂我軍乏水草，不能深入，不設備。又大風揚沙畫晦，軍行皆不知。元主方欲北行，整軍馬皆北向。忽大軍至，其太尉蠻子倉卒拒戰，擊敗之，殺蠻子，其眾遂降。元主脫古思帖木兒與其太子天保奴、知院捏怯來、丞相失烈門數十騎遁去。玉率精騎追之，不及，獲其次子地保奴等六十四人，及故太子必裡禿妃並公主等五十九人，其詹事院同知脫因帖木兒將逃，失馬竄草間，擒之，及追獲吳王朶兒只、代王達裡麻、平章八蘭等二千九百九十四人，軍士男女七萬七千三十七口，得寶璽、圖書、金銀印章、馬駝牛羊車輛，各籍數入奏。聚其甲兵悉焚之，遂班師。
　　二十二年（己巳，一三八九）夏五月癸巳，置太寧、福餘、朶顏三衛於兀良哈，以故元歸附阿禮失里為泰寧衛指揮使，塔賓帖木兒為指揮同知，海撒奚為福餘衛指揮同知，脫魯忽察兒為為朶顏衛指揮同知各領所部以安畜牧。
　　秋七月，元也速迭兒弒其主脫古思帖木兒，立坤帖木兒。其部屬皆奔散，元裔日微。
　　二十三年（庚午，一三九０）春正月，命傅友德為大將軍，率列侯趙庸、曹興、王弼、孫恪等赴北平，訓練軍馬，聽燕王節制，出征沙漠。敕王弼以山西聽晉王節制。
　　三月，燕王率傅友德等出古北口，哨得乃爾不花等駐牧迤都，遂進兵。適大雪，諸將欲止，燕王曰：「天雨雪，彼不虞我至，宜乘雪速進。」癸巳，遂抵迤都，隔一磧，敵不知也。乃先遣指揮觀童逕詣其營。觀童與乃兒不花有舊，至則相抱持泣。倉卒之頃，我師已壓其營。眾大驚，乃兒不花等欲上馬走，觀童諭以燕王至，毋恐。乃兒不花與俱詣軍門降，燕王降辭色待之，賜之酒，慰諭遣還。乃兒不花大喜過望，於是悉收其部落、馬駝牛羊而還。報捷京師，上大喜曰：「肅清沙漠者，燕王也！」
　　二十四年（辛未，一三九一）春三月，元遼王阿札失理寇邊，命潁國公傅友德率列侯郭英等討之。
　　五月，至哈者舍利王道，友德遽下令班師，敵聞，信之。越二日，忽趨師深入。
　　六月，至黑嶺、鴉山等處洮兒河，獲人口馬匹，駐師金鞍子山。
　　七月，復征黑嶺、寒山，至磨鎌子海、蘭尖山，追其渠札都，深入黑松林之地野人所居熊皮山。追達達兀刺罕，掩襲其眾，大獲而還。
　　八月哈密寇邊，命都督宋晟、劉真率師討之。
　　九月，晟等破哈密，擒其王子別別怯、豳王桑裡失哥、知院嶽山等，殺其國公阿朶只，俘眾一千三百人。
　　二十五年（壬申，一三九二）夏四月，涼國公藍玉率將士追逃寇祁者孫，遂進征西番罕東之地。五月，藍玉兵至罕東，遣都督宋晟等徇阿真州，土渠合咎等遁去。尋奉詔移兵，討建昌叛帥月魯帖木兒。
　　秋七月癸未，四川都指揮使瞿能率兵至雙狼寨，攻破之，擒偽千戶段太平等，其眾大潰。月魯帖木兒遁去，能督兵追捕，進攻托落等寨，拔之。月魯帖木兒復遁，能轉戰而前，破水寨關及上匾寨，進至打衝河三里所，與月魯帖木兒遇，大戰，破走之，俘其眾五百餘人，溺死者千計，獲牛馬無算。官軍入德昌，知府安德渡打衝河遁去，能遂調都指揮同知陶凱分兵入普濟州搜捕之，獲。駕橋於打衝河，遣指揮李華引兵追托落寨餘孽。進至水西，斬月魯帖木兒把事七人，其截路寨土渠長沙納的等皆中矢死。能還攻天星、臥漂諸寨，皆克之，先後俘殺千八百餘人。月魯帖木兒復遁入柏興州，九月，罕西西番叛入寇，命都督宋晟總兵討平之。
　　十一月甲午，藍玉兵次柏興州，遣百戶毛海以計誘致月魯帖木兒並其子胖，其眾悉降。送月魯帖木兒至京師，伏誅。玉奏：「四川之境，地曠山險，控扼西番，宜增置屯衛。順慶府鎮御巴梁、大行諸縣，其保寧千戶所，北通連雲棧，宜改為衛。漢州、灌縣西連松、茂、硐黎，當土番出入之地；眉州控制馬湖、建昌、嘉定，接山都、長九寨，俱為要道，皆宜置軍衛。」下群臣議，行之。
　　都督周興帥兵討元逆臣也速迭兒。興追至徹徹兒山，破之。
　　十二月壬申，馮勝等奉命率列侯籍太原、平陽民為兵伍，置衛屯田。東勝立五衛，大同立五衛，大同迤東立五衛。衛五千六百人。
　　二十九年（丙子，一三九六）春三月，寧王權言：「騎兵巡塞，見有脫輻遺道上，恐敵兵往來，有盜邊之舉。」上曰：「狡寇多奸，此必示弱，誘我軍耳。」於是敕燕王選精卒抵大寧，沿河南北覘北兵所在，隨宜掩擊。
　　甲子，燕王率諸軍北至徹徹兒山，遇元兵，與戰，擒其將索林帖木兒等數十人。追至兀良哈禿城，遇兀刺兀海，戰敗之。