丙寅，賊陷鳳陽，鳳陽無城郭，賊大至，官軍無一人迎敵者，遂潰。賊焚皇陵，樓殿為燼，燔松三十萬株，殺守陵太監六十餘人，縱高牆罪宗百餘人。留守朱國巷戰，斬賊二十七人，力竭死。渠掃地王、太平王入府治，知府顏容暄囚服匿獄中，賊縱囚，獲之，賊渠張蓋鼓吹坐堂上，杖容暄於堂下，殺之。推官萬文英等六人，武官四十一人俱殺。士民被殺者數萬，剖孕婦，注嬰兒於槊，燔公私邸舍二萬二千六百五十餘間，光燭百里。賊渠列幟自稱古元真龍皇帝，恣掠三日。
　　戊辰，太監盧九德、總兵楊御蕃以川兵三千救鳳陽，南京兵亦至。賊奔，以筳蒪卜於神祠，不利，刳神像而去。賊拔營南下，沿途殺掠無遺，趨廬州。
　　丁卯，命洪承疇趣東馳剿寇。
　　甲戌，鳳陽賊陷巢縣，已，攻舒城，知縣章可試塞三門，開西門誘賊入，陷於坑，奔潰死千人，因掠霍山、合肥諸縣。是日圍六合，聚稚子百十，環木焚之，聽其哀號，以為笑樂。又裸婦人數千，詈於城下，少有媿阻，即磔之，攻三日而去。出帑金二十萬助剿餉；發太僕金十萬輸西安；其湖廣餉十九萬，資鎮篁等兵；鹽課十萬，貯淮、揚以防寇逸。初，兵部會戶部，調南北主客兵七萬，馬一萬五千，每兵日銀三分，米一升五合，馬日草一束，銀二分，豆三升，銀二分。計五閱月，約十一萬金云。
　　戊寅，江北賊自舒城抵廬江，邑人具幣求免，偽許之，夜襲城，城陷。
　　己卯，陷無為州。洪承疇抵河南，河南諸盜知承疇至，又入潼關。承疇遣副總兵來胤昌以千二百人往戍西安，令總兵秦翼明、游來朝間道向山東趨徐州，捍江北逸寇。
　　庚辰，江北賊滿天星、張大受等攻桐城，不利。賊渠乘輿繞城呼降，守將射中其腰，夜走潛、太諸邑。諸邑多山氓，習獵，射虎豹，藥弩窩弓甚設，所在結寨殺賊，賊遂西向麻城，抵漢口。
　　二月，癸未，江北賊陷潛山。乙酉，陷羅田。命總兵曹文詔剿寇陳、許。時湖廣扼賊，賊仍走太湖，攻陷之。而河南賊迫於諸路兵，其在南陽者，過應、隨駐棗陽。在汝寧者則入黃州。而鳳、潁賊入英、霍、蘄、黃一帶，擾殆遍。其在嵩、盧、靈、陝諸寇，密邇潼關。雒南者，又折入秦中，約六七萬，西安諸縣並遭蹂躪。有四大營，北渡渭，突剽邠、耀間。其山西寇，則在平陽、汾州諸縣，並野掠，而土寇助之。
　　癸未，巡按鳳陽御史吳振纓始以皇陵之變疏聞。是日，上當御經筵，特傳免，素服避殿，親祭告太廟，命百官修省，俱素服從事。逮巡撫鳳陽都御史楊一鵬並振纓下獄。一鵬論死，棄西市，振纓遣戍。
　　乙未，命侍郎朱大典總督漕運，巡撫鳳陽，同洪承疇協剿。承疇請：「四川撫鎮俱移夔門、達州，進援襄、漢；湖廣撫鎮分駐承天、襄陽；鄖撫移駐鄖、襄，漕督移駐潁、亳，進援汝寧、歸德；山東撫臣移鎮曹、濮，進援江北、江南；山西撫臣移蒲州，進援靈、陝；陝西撫臣移商州，調度興安、漢中；河南撫臣移汝南、南陽間；保定撫鎮移駐邯鄲、磁州，可南北策應。」從之。
　　三月癸丑，湖廣賊陷麻城。
　　丙辰，省臣乞蠲陝西八年以上逋租，不許。
　　庚申，蘄、黃大盜爬天王擁眾八百餘人，村民擒之。身長八尺，自言：「天亡我，非我罪也」。倡亂十二年，陷十州縣，其子日啖人心，發、雙目俱赤。先是，鳳陽賊奔蘄、黃，洪承疇次汝寧，慮其再入江北，令鄧（王巳）扼之。令曹文詔邀之應、隨間，又總兵賀人龍、劉成功率兵分駐信陽、泌陽，恐其入豫也。
　　壬戌，漢中賊陷寧羌。
　　丙子，總兵鄧（王巳）為叛率殺於樊城。（王巳）無紀律，所將蜀兵好淫掠。俄騎營畔，（王巳）避樓墜火死。舉營北竄，惟步卒未動，洪承疇命副總兵賈一選、周繼元分領之。是月，給事中常自裕言：「皇上赫然振怒，調兵七萬，其實不過五萬；且分之各處，未足遏賊。鳳陽焚劫四日而馬爌至，歸德圍解三日而鄧（王巳）來，潁、亳、安、廬之賊返旆而北，尤世威等信尚杳然。至賀人龍等，各處淫掠，所謂賊梳而軍櫛也。唯皇上嚴飭之，以伸軍法。」
　　四月乙酉，承疇次汝州，以各寇之復入秦也，率諸將自汝入秦，檄曹文詔以師會。
　　丙午，承疇次靈寶，文詔自南陽至。以商、雒為賊藪，漢中、興平其寄境也，令文詔出閿鄉，直搗商、雒，自馳興安，遏其奔軼。
　　五月甲寅，曹文詔夜至五峪，寇伏險以誘，文詔擊敗之。張全昌自咸陽出興平之東，老回回等拒官兵，營五十里。賀人龍南入子午谷，奪其南徑。劉成功及游擊王永祥往東南，遏其北走，夜渡河走郿縣，承疇亦渡河追之。
　　丙辰，至王渠鎮。寇方下南山恣掠，賀人龍遽擊走之，追至大泥峪，寇舍騎登山。
　　丁巳，官兵至縣之秦王嶺，值寇，張全昌擊敗之。自是商、雒之寇逃終南山中，餘寇西奔興平。蓋冬、春之間，寇奔豫，奔楚，奔江北，其勢多而且散，至是寇又悉萃於秦矣。
　　六月壬午，下河南巡撫玄默於獄。
　　丁酉，免陝西巡撫李喬官，議罪，以庸懦玩寇也。以甘學闊巡撫陝西。
　　乙酉，秦賊搖天動襲陷西和。
　　丙午，總兵曹文詔至娑羅寨，寇大至，力竭自刎。文詔敢鬥，前後殺賊萬計，為賊所畏，官軍聞之奪氣。秦賊在晉者，巡撫吳甡會兵逐之，走河南，惟顯道神、活地草、鄉里人三營留晉。甡方謀合兵剿滅，會西人入塞，斂兵防河，賊復熾。
　　七月癸亥，秦賊陷澄城。
　　八月壬午，陷咸陽。
　　丁酉，商、雒寇復入河南，犯盧氏。
　　癸卯，命湖廣巡撫盧象升總理直隸、河南、山東、四川等處軍務，統關、遼兵，賜尚方劍，便宜行事，端制中原。洪承疇剿寇西北，象升剿寇東南。如寇入秦，象升進兵合擊。
　　十月壬辰，老回回襲陷陝州。
　　乙巳，上下詔罪，已避居武英殿，減膳徹樂，除典禮外，惟以青衣從事，以示與行間文武士卒甘苦相同之意。先是，賊翻山鷂降於承疇，賊首闖王退屯乾州，承疇令降賊翻山鷂說之，不聽，南走武功。承疇追擊敗之，闖王率大隊自盩厔、武功分道渡河。
　　十一月辛酉，河南賊焚關廂而西。老回回犯南、鄧。秦賊一字王等部眾二十萬，撞天王統十七萬，自潼關出犯閿鄉、靈寶，大隊東行，塵埃漲天，闊四十里，絡繹百里，老弱居中，精騎居外。左良玉與總兵祖寬兩軍相隔，東西七十里，遙望山頭，不敢邀擊。賊抄掠諸路，截燒糧草，諸軍乏食。秦賊屯於鄜州，綿亙百里。